Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC47Q96A33 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC47Q96A33 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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