Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC9Q92623 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC9Q92623 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms