Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOPBP1Q92547 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
TOPBP1Q92547 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TOPBP1Q92547 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
TOPBP1Q92547 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms