Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CSRNP3Q8WYN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CSRNP3Q8WYN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CSRNP3Q8WYN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CSRNP3Q8WYN3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CSRNP3Q8WYN3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CSRNP3Q8WYN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms