Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC44A1Q8WWI5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC44A1Q8WWI5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC44A1Q8WWI5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC44A1Q8WWI5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC44A1Q8WWI5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC44A1Q8WWI5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms