Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf3Q8WVX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4orf3Q8WVX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4orf3Q8WVX3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms