Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STK35Q8TDR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STK35Q8TDR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STK35Q8TDR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms