Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNLDC1Q8NA58 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNLDC1Q8NA58 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms