Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYNE4Q8N205 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNE4Q8N205 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYNE4Q8N205 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms