Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CMTR1Q8N1G2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CMTR1Q8N1G2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CMTR1Q8N1G2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms