Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACE1Q8IYU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACE1Q8IYU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACE1Q8IYU2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms