Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TREML1Q86YW5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TREML1Q86YW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms