Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NLRP13Q86W25 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP13Q86W25 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NLRP13Q86W25 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms