Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC137Q6PK04 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms