Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED27Q6P2C8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED27Q6P2C8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms