Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRAGBQ5VZM2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRAGBQ5VZM2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRAGBQ5VZM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms