Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC39BQ5VTQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC39BQ5VTQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms