Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP8L3Q5GJ75 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms