Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNI3KQ59H18 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNI3KQ59H18 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI3KQ59H18 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms