Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD12Q587J7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRD12Q587J7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms