Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESCO2Q56NI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ESCO2Q56NI9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms