Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KHDC1Q4VXA5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KHDC1Q4VXA5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KHDC1Q4VXA5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.5 ms