Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CA9Q16790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA9Q16790 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA9Q16790 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA9Q16790 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA9Q16790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA9Q16790 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA9Q16790 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CA9Q16790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA9Q16790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA9Q16790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA9Q16790 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA9Q16790 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA9Q16790 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA9Q16790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA9Q16790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA9Q16790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA9Q16790 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA9Q16790 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA9Q16790 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA9Q16790 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA9Q16790 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA9Q16790 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA9Q16790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA9Q16790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA9Q16790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA9Q16790 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA9Q16790 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA9Q16790 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA9Q16790 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA9Q16790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA9Q16790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA9Q16790 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA9Q16790 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA9Q16790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA9Q16790 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms