Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIF1AQ16665 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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