Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
E2F4Q16254 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F4Q16254 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F4Q16254 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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