Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNCBQ16143 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNCBQ16143 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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