Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1EQ15878 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1EQ15878 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1EQ15878 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms