Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1AQ15573 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1AQ15573 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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