Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCOLCEQ15113 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCOLCEQ15113 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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