Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN5AQ14524 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN5AQ14524 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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