Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCARB2Q14108 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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