Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM28Q13263 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM28Q13263 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM28Q13263 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM28Q13263 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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