Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
GRIN2AQ12879 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
GRIN2AQ12879 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
GRIN2AQ12879 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
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