Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBBP4Q09028 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBBP4Q09028 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms