Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRTAP1-1Q07627 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KRTAP1-1Q07627 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP1-1Q07627 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms