Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSME1Q06323 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PSME1Q06323 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSME1Q06323 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms