Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID5AQ03989 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms