Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBA1Q02410 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBA1Q02410 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms