Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTBN1Q01082 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.4 ms