Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC42EP1Q00587 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC42EP1Q00587 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.7 ms