Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EFNB1P98172 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNB1P98172 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms