Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIM1P81133 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIM1P81133 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIM1P81133 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIM1P81133 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIM1P81133 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIM1P81133 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIM1P81133 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIM1P81133 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIM1P81133 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIM1P81133 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIM1P81133 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIM1P81133 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIM1P81133 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIM1P81133 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIM1P81133 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIM1P81133 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIM1P81133 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIM1P81133 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIM1P81133 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIM1P81133 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIM1P81133 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIM1P81133 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIM1P81133 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIM1P81133 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIM1P81133 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIM1P81133 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIM1P81133 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIM1P81133 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIM1P81133 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIM1P81133 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIM1P81133 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIM1P81133 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIM1P81133 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIM1P81133 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIM1P81133 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIM1P81133 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIM1P81133 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIM1P81133 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIM1P81133 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIM1P81133 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIM1P81133 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIM1P81133 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIM1P81133 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIM1P81133 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIM1P81133 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIM1P81133 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIM1P81133 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIM1P81133 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIM1P81133 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIM1P81133 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIM1P81133 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIM1P81133 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIM1P81133 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIM1P81133 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIM1P81133 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIM1P81133 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIM1P81133 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIM1P81133 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIM1P81133 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIM1P81133 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIM1P81133 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms