Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NCS1P62166 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCS1P62166 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCS1P62166 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCS1P62166 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCS1P62166 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCS1P62166 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCS1P62166 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCS1P62166 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCS1P62166 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCS1P62166 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCS1P62166 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCS1P62166 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCS1P62166 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCS1P62166 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCS1P62166 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCS1P62166 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCS1P62166 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NCS1P62166 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NCS1P62166 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCS1P62166 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCS1P62166 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms