Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms