Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RIPK4P57078 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RIPK4P57078 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RIPK4P57078 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms