Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYS2P54840 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYS2P54840 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYS2P54840 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYS2P54840 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYS2P54840 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYS2P54840 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYS2P54840 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYS2P54840 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GYS2P54840 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GYS2P54840 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GYS2P54840 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GYS2P54840 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GYS2P54840 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GYS2P54840 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GYS2P54840 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GYS2P54840 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYS2P54840 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYS2P54840 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYS2P54840 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYS2P54840 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYS2P54840 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYS2P54840 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYS2P54840 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYS2P54840 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYS2P54840 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYS2P54840 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYS2P54840 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYS2P54840 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYS2P54840 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GYS2P54840 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GYS2P54840 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYS2P54840 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYS2P54840 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GYS2P54840 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GYS2P54840 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GYS2P54840 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYS2P54840 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYS2P54840 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYS2P54840 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYS2P54840 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYS2P54840 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.3 ms