Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD23AP54725 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms