Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS1P54277 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS1P54277 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS1P54277 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS1P54277 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PMS1P54277 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS1P54277 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS1P54277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS1P54277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS1P54277 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS1P54277 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS1P54277 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS1P54277 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS1P54277 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS1P54277 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS1P54277 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS1P54277 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS1P54277 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMS1P54277 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS1P54277 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PMS1P54277 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS1P54277 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS1P54277 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS1P54277 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMS1P54277 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS1P54277 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS1P54277 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS1P54277 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS1P54277 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS1P54277 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS1P54277 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS1P54277 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS1P54277 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMS1P54277 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS1P54277 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS1P54277 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS1P54277 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS1P54277 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS1P54277 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS1P54277 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms