Protein–RNA interactions for Protein: P51665

PSMD7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD7P51665 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD7P51665 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD7P51665 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMD7P51665 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMD7P51665 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD7P51665 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms