Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDO2P48775 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDO2P48775 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDO2P48775 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDO2P48775 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDO2P48775 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDO2P48775 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDO2P48775 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDO2P48775 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDO2P48775 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDO2P48775 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDO2P48775 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDO2P48775 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDO2P48775 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDO2P48775 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDO2P48775 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDO2P48775 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDO2P48775 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDO2P48775 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TDO2P48775 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDO2P48775 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDO2P48775 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TDO2P48775 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TDO2P48775 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDO2P48775 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TDO2P48775 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDO2P48775 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TDO2P48775 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDO2P48775 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDO2P48775 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDO2P48775 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDO2P48775 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDO2P48775 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDO2P48775 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDO2P48775 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDO2P48775 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDO2P48775 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDO2P48775 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDO2P48775 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDO2P48775 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDO2P48775 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDO2P48775 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDO2P48775 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDO2P48775 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDO2P48775 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDO2P48775 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDO2P48775 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDO2P48775 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDO2P48775 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDO2P48775 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDO2P48775 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDO2P48775 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TDO2P48775 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDO2P48775 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TDO2P48775 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDO2P48775 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDO2P48775 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDO2P48775 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDO2P48775 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDO2P48775 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDO2P48775 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDO2P48775 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDO2P48775 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDO2P48775 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDO2P48775 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms